Protein–RNA interactions for Protein: Q96C34

RUNDC1, RUN domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC1Q96C34 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
RUNDC1Q96C34 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.1 ms