Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H4Q92759 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms