Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HJURPQ8NCD3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms