Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I0

SYT2, Synaptotagmin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT2Q8N9I0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT2Q8N9I0 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SYT2Q8N9I0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms