Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
VWA5B2Q8N398 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms