Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
KCNMB4Q86W47 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms