Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z614

SNX20, Sorting nexin-20, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX20Q7Z614 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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SNX20Q7Z614 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SNX20Q7Z614 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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