Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
CCBE1Q6UXH8 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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