Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATG16L1Q676U5 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms