Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ODF2Q5BJF6 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms