Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms