Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SP6Q3SY56 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms