Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TTLL9Q3SXZ7 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms