Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PDK4Q16654 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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