Protein–RNA interactions for Protein: Q16572

SLC18A3, Vesicular acetylcholine transporter, humanhuman

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A3Q16572 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SLC18A3Q16572 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
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