Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZIC1Q15915 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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