Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ATP6AP1Q15904 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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