Protein–RNA interactions for Protein: Q15822

CHRNA2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA2Q15822 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CHRNA2Q15822 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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