Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ZNHIT3Q15649 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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