Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRADDQ15628 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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