Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
RAB35Q15286 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
RAB35Q15286 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms