Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRRQ15256 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms