Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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PDCD1Q15116 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD1Q15116 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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