Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
FAM53BQ14153 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms