Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
COL9A3Q14050 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms