Protein–RNA interactions for Protein: Q13885

TUBB2A, Tubulin beta-2A chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2AQ13885 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TUBB2AQ13885 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128 ms