Protein–RNA interactions for Protein: Q13643

FHL3, Four and a half LIM domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL3Q13643 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
FHL3Q13643 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms