Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CUL4AQ13619 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CUL4AQ13619 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
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