Protein–RNA interactions for Protein: Q13541

EIF4EBP1, Eukaryotic translation initiation factor 4E-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4EBP1Q13541 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
EIF4EBP1Q13541 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms