Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
LSAMPQ13449 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TRPV4-202ENST00000418703 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LSAMPQ13449 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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LSAMPQ13449 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
LSAMPQ13449 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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