Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
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ITGB3BPQ13352 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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ITGB3BPQ13352 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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ITGB3BPQ13352 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
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ITGB3BPQ13352 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ITGB3BPQ13352 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
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