Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RNF183-206ENST00000478815 2312 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CBX3Q13185 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MAP3K12-203ENST00000547035 2944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TOE1-201ENST00000372090 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ITGB2-201ENST00000302347 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SH3KBP1-205ENST00000397821 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
CBX3Q13185 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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