Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRDM2Q13029 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRDM2Q13029 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
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