Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GRIK2Q13002 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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