Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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FOXF2Q12947 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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FOXF2Q12947 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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FOXF2Q12947 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
FOXF2Q12947 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
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FOXF2Q12947 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
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FOXF2Q12947 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
FOXF2Q12947 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
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