Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LINC00969-257ENST00000625632 898 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AP001527.2-201ENST00000614441 631 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PDHB-206ENST00000474765 1503 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PTPN13Q12923 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms