Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GRIN2AQ12879 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GRIN2AQ12879 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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