Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
STX4Q12846 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
STX4Q12846 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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STX4Q12846 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
STX4Q12846 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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