Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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EFEMP1Q12805 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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EFEMP1Q12805 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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EFEMP1Q12805 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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EFEMP1Q12805 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
EFEMP1Q12805 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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