Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KCNA1Q09470 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms