Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
DEUP1Q05D60 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms