Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OC90Q02509 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OC90Q02509 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms