Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP27A1Q02318 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP27A1Q02318 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms