Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CDR2Q01850 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms