Protein–RNA interactions for Protein: Q01362

MS4A2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A2Q01362 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
MS4A2Q01362 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms