Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
HOXC5Q00444 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms