Protein–RNA interactions for Protein: Q00266

MAT1A, S-adenosylmethionine synthase isoform type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAT1AQ00266 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MAT1AQ00266 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms