Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DCDC1P59894 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DCDC1P59894 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms