Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CACNB3P54284 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms