Protein–RNA interactions for Protein: P51587

BRCA2, Breast cancer type 2 susceptibility protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA2P51587 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
BRCA2P51587 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
BRCA2P51587 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms